红叶李小苗常见的病虫害主要有褐斑穿孔、细菌性穿孔等.
褐斑穿孔 褐斑病是一种真菌病害，菌丝体在病叶中越冬。病菌借助风雨传播，一般从6月开始发病，8月份为高峰期。多风多雨时发病严重。病叶初期产生褐色小点，后扩展成同心状病斑，直径3毫米左右。病斑中央黄白色或褐色，边缘紫褐色。后期病斑脱落形成穿孔。该病多危害老叶。
防治方法：秋冬季清除，烧掉枯枝残叶，减少传染源；用药剂防治可在紫叶李萌芽前喷洒波美3度至5度石硫合剂或1:1:120倍等量式波尔多液。展叶后喷80%代森锌可湿性粉剂600倍液，每隔7天至10天喷1次，连喷3次即可。
细菌性穿孔 一般由细菌引起，致病细菌在枝梢或病叶上越冬。来年春季借雨水或昆虫传播侵染。叶片发病时，初为水渍状小点，后扩大成圆形病斑，病斑周围有紫色晕环，之后，病斑干枯脱落，形成穿孔，有的多个病斑相连形成焦枯状大班，干燥脱落后形成大的穿孔，严重时造成叶片脱落。枝条受害后形成溃疡，受害部位成暗紫色病斑，病斑上常发生大小不同程度的裂纹。该菌发育的适宜温度是24℃至28℃，华北地区一般5月发病，夏季高温高湿季节发病高峰期。严重时8月至九月份整理树的叶子都会千疮百孔、斑斑驳驳，影响观赏效果。
防治方法：加强肥水管理，增强植株抗病性；春季合理修剪，增加植株透风、透光性；注意防治蚜虫、草履蚧等刺吸式害虫，减少传染机率；春季发芽前可喷3度石硫合剂进行杀菌预防；发病期间喷95%细菌灵或65%的代森锌500倍液，效果较好。